聚氯化鋁對于醫藥界的制藥廢水的處理過程，是通過事先了解制藥廢水所含有的諸多污染物，通過聚氯化鋁絮凝分解其水中的有毒、有害和難以降解的微生物，逐漸緩解水中的污染，以達到一個凈化的目的，由于制藥廢水中呈明顯的酸、堿性，部分污水中含有過高的鹽分，屬于較為難處理的一種污水。
制藥廢水的水質特點使得多數制藥廢水單獨采用生化法處理根本無法達標，所以在生化處理前必須進行必要的預處理。根據制藥廢水的水質特點，在其處理過程中需要采用物化處理作為生化處理的預處理或后處理工序。目前應用的物化處理方法主要包括混凝、氣浮、吸附、氨吹脫、電解、離子交換和膜分離法等。混凝法處理制藥廢水是目前國內外普遍采用的一種水質處理方法，它被廣泛用于制藥廢水預處理及后處理過程中，如聚氯化鋁、硫酸鋁和聚合硫酸鐵等用于中藥廢水等，混凝處理的關鍵在于恰當地選擇和投加性能優良的混凝劑。
